در سال ۲۰۰۰ یک دادگاه حقوق بشر بر اساس قانون شماره ۲۶ سال ۲۰۰۰ برای بررسی انواع نقض حقوق بشر تاسیس شد.
بر اساس حکم ریاست جمهوری شماره ۵۰ سال ۱۹۹۳، دولت کمیسیون ملی حقوق بشر را برای بهبود اجرای حقوق بشر در اندونزی تاسیس کرد.