هونشو بعد از گرینلند، گینه نو، بورنئو، ماداگاسکار،بافین و سوماترا هفتمین جزیره بزرگ جهان،جزیره هوکایدو مقام۱۹و کیوشو مقام ۳۱را دارند. (شامل خشکی های قاره ای مانند استرالیا نمی‌شود)

از بین جزایر دور افتاده مسکونی، کل مساحت ۳۰۴ مورد تعیین شده در قانون،مربوط به توسعه جزایر از راه دور، ۲٪ از کل زمین اراضی ژاپن است وفقط ۰.۵٪ از جمعیت ملی در آنجا زندگی می کنندوبیش از ۷۰٪ جمعیت ۵۰۰ نفر یا کمتردارند.

از نظر استان، ناگاساکی دارای بیشترین جزایر با ۹۷۱مورداز جمله ایکی، تسوشیما وگوتو است و اوگاشیما (عکس)، بخشی از جزایر ایزو و مشهور به داشتن دهکده ای با کمترین جمعیت در ژاپن است که شهرداری توکیو آن را اداره می‌کندوبنابراین توکیو، یکی از بزرگترین شهرهای جهان، کوچکترین روستای ژاپن رانیز اداره می کند.